A mudança do tipo de natureza de operação tem duas maneiras aonde pode fazer essa correção ou mudança.
Método 1
Conta da Nota Fiscal
Vai no topo da página e procure uma engranagem, assim poderá achar as configurações da nota fiscal.
Procure a sua conta da Nota Fiscal e clique em Configurações como mostrado abaixo.
Na parte de Imposto escolha o que for referente ao seu uso.
Método 2
Pedidos
Dentro dos pedidos vai no estado Fatura Pendente, e clique em Mais e a seguir clique em Detalhes como mostrado abaixo
Após clicar em Detalhes clique em Mais Informação
Escolha o tipo de Imposto no sistema
Selecionando a caixinha, todos os pedidos que vierem com o produto vai sair de acordo com o tipo de imposto que você definiu, se não quiser, basta não selecionar.